Permissões no linux

R W X
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Basta somar

Ex: 644 : RW - R - R

montar um pendrive via terminal

veja onde está seu pendrive desmotado , ou seja , em qual unidade ele está montando

fdisk -l

(provavelmente /dev/sdb1 depende do numero de hds q vc tem)

crie um diretório para montar seu pendrive (como root)

mkdir -p /mnt/usbpen

monte-o

mount /dev/sda1 /mnt/usbpen

Copiar mantendo permissões

Quando vc precisa usar um comando como esse , vc é uma pessoa organizada..

cp -pr origem destino

LAMP

sudo aptitude install apache2 mysql-server-5.0 php5 php5-mysql php5-cli -y